Jagged Alliance 3D est un jeu de stratégie tactique où les joueurs prennent le commandement d'une équipe de mercenaires. Plongé dans un contexte de conflits en Afrique, le joueur doit gérer des missions variées tout en affrontant différents ennemis. Avec une multitude de missions à réaliser et des personnages uniques avec des compétences distinctes, chaque choix tactique a un impact sur l'issue des opérations.