Dans Pokémon Donjon Mystère : Équipe de Secours Bleue, les joueurs incarnent des Pokémon qui doivent explorer des donjons générés aléatoirement. Ils forment une équipe de secours avec d'autres Pokémon afin d'aider leurs camarades en détresse. Le jeu propose une aventure captivante où il faut découvrir des secrets, combattre des ennemis et recueillir des trésors tout en développant les compétences de ses Pokémon.