Dans Mystery Case Files : MillionHeir, les joueurs incarnent un détective amateur chargés de résoudre une série d'énigmes captivantes. Ils partent à la recherche d'un héritier maléfique en explorant des décors magnifiquement illustrés et en dénichant des objets bien cachés. En utilisant le stylet de la Nintendo DS, les joueurs interagissent avec le monde du jeu pour trouver des indices, tout en profitant d'options multijoueurs en mode compétitif ou coopératif qui ajoutent du piquant à l'expérience de jeu.