Dans Negima : Chou Mahora Taisen Kattoiin, les joueurs sont plongés dans l'univers de Negima, où ils incarnent Negi Springfield, un jeune professeur de magie. L'objectif est de rassembler sa classe de 31 étudiantes disparues. À travers des graphismes 2D colorés, le joueur doit interagir avec les personnages grâce à l'écran tactile de la Nintendo DS, tout en menant des batailles stratégiques contre diverses créatures. Ce jeu allie aventures, combats tactiques et éléments de simulation pour offrir une expérience immersive aux fans de la série.