NiGHTS : Journey of Dreams plonge le joueur dans un monde fantastique où deux enfants, Helen et Will, se battent contre leurs pires cauchemars. Grâce à l'aide de NiGHTS, une créature mystérieuse, ils explorent Nightopia pour affronter Wiseman, la source de toutes leurs terreurs nocturnes. En combinant leurs forces avec NiGHTS, ils doivent surmonter des obstacles et redécouvrir la confiance en eux pour vaincre les Nightmarens et triompher sur leurs peurs.