Dans Mega Man Battle Network 4 : Blue Moon, les joueurs rejoignent Lan Hikari et son fidèle compagnon Mega Man alors qu'ils se plongent dans une aventure palpitante où ils doivent naviguer entre le monde virtuel et le monde réel. Ce jeu de rôle stratégique introduit un système de combat en temps réel basé sur des cartes, permettant aux joueurs de combiner différentes capacités et tactiques. Lan et Mega Man doivent affronter des ennemis puissants, collecter des chips, et faire face à la menace des Dark Chips, qui corrompent leur utilisateur. Les choix des joueurs influenceront le cours de l'histoire, offrant une expérience unique à chaque partie.