Dans Pikmin 3, vous incarnez un explorateur d'une planète lointaine qui doit collecter des fruits à l'aide de créatures fascinantes appelées Pikmin. En exploitant les compétences uniques de chaque type de Pikmin, vous devrez résoudre des énigmes et surmonter des obstacles tout en faisant face à des ennemis. Le jeu propose également des modes de coopération à deux joueurs, permettant de travailler ensemble pour atteindre vos objectifs et découvrir les secrets de ce monde coloré.